Romano n.? - m. 1044
Pontificato 1032 - 1044
Nome: Teofilatto dei Conti del Tuscolo

Un'altra elezione papale nella famiglia di Teofilatto, ottenuta comprando i voti di ecclesiastici corrotti.
Benedetto IX, secondo figlio del console Alberico III dei Conti del Tuscolo, nipote di Benedetto VIII e di Giovanni XIX, fu eletto papa non ancora dodicenne, dicono alcuni, ma comunque ancora adolescente.
A credere ciò che è stato scritto di lui, fu ladro e assassino, condusse una vita licenziosa e scellerata tanto che questo è considerato il periodo più oscuro del papato.
Una rivolta popolare lo scacciò da Roma nel 1044 e fu sostituito da un altro papa, Silvestro III.
Nel 1045 Benedetto riesce a tornare a Roma e riprende il suo posto anche perché nessun concilio aveva dichiarato nulla la sua elezione.
Dopo un mese, abdicando volontariamente, non esitò a vendere il seggio pontificio all'arciprete Giovanni Graziano che diventò papa col nome di Gregorio VI.
Nel 1046 scese in Italia l'imperatore Enrico III deciso a riformare la Chiesa. Convocò un concilio nel quale depose tutti i papi eletti fino ad allora ed elesse papa Clemente II.
Nel 1047, tornato in Germania Enrico III, approfittando della provvidenziale morte di Clemente, si rifece avanti Benedetto IX che tornò a Roma e si reinsediò sul trono dal quale fu scacciato l'anno seguente dai legati imperiali che lo rimpiazzarono con Damaso II.
Benedetto IX morì nel 1050 e venne sepolto nell'abbazia di Grottaferrata.

Malgrado la grande confusione di questo periodo storico, Benedetto IX viene iscritto per tre volte nell'Annuario pontificio, così come risultano legittimi i papi eletti contemporaneamente a lui: Silvestro III,Gregorio VI, Clemente II e Damaso II.