L'elenco ufficiale dei papi conta 265 pontefici.

Dall'elenco manca Felice II in quanto un antipapa di questo nome fu confuso con un Felice martire ed iscritto in un primo tempo nel Liber pontificalis e poi cancellato.

Benedetto IX compare tre volte nell'elenco:
fu eletto nel 1032; fu deposto nel 1044 e riprese il trono nel 1045 abdicando lo stesso anno; fu per la terza volta sul trono nel 1047 e definitivamente deposto l'anno dopo.
Il numero reale dei papi è quindi di 263 e non di 265.

In alcuni casi hanno regnato contemporaneamente 2 o più papi, inclusi nell'Annuario pontificio:
Giovanni XII (955 - 964) deposto nel 963
Leone VIII (963 - 965) eletto al posto di Giovanni XII, ha regnato in contemporanea con questo per un anno.
Benedetto V (964 - 965) eletto alla morte di Giovanni XII ha regnato in contemporanea con Leone VIII per un anno.

Durante il triplice pontificato di Benedetto IX furono eletti altri 2 papi: Silvestro III e Gregorio VI che per un periodo regnarono contemporaneamente.
Tutti e tre sono iscritti nell'Annuario pontificio.

Dopo Stefano I fu eletto nel 752 uno Stefano che però non fu incluso nell'elenco dei papi perché morì 4 giorni dopo la consacrazione pur essendo la nomina valida a tutti gli effetti.
Pertanto Stefano II è da considerarsi III e così via per gli altri papi di nome Stefano.

Nell'Annuario pontificio non risulta un Giovanni XX, saltato dalla numerazione per un errore di trascrizione.